| MirGeneDB ID | Dme-Mir-989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-989 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dme-mir-989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-989 Aga-Mir-989 Dan-Mir-989 Dlo-Mir-989 Dmo-Mir-989 Dsi-Mir-989 Dya-Mir-989 Gpa-Mir-989 Hme-Mir-989-P1 Hme-Mir-989-P2 Tca-Mir-989 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Endopterygota | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Endopterygota | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2R: 14145365-14145508 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUGAUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUUUAUUUAAGUACAAAGAUUUUGGGAAUCGGCCACUACCUUGCAGUCACGUGAUGAAAAGACACAGGUGACACUGAUCCGGAUUUGGUAGUUGACAAAUCCUCCAUGCCGAGAUUAGUUUCAUUUUGCGUCUUUUGAAUUCGAAUAGUUCAUGUGAUGUGACGUAGUGGAACAUACCUGAAAUUACAAGCAACACGAAGUGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 UUUUAUUUAAGUACAAA--| UG A CGG C UG G AUGAAAAGACACAGGUGACACUGAUCCGGAUUUGGUAGUUGACAAAUC GAUUU GG AU CCACUAC U CA UCACGUG \ UUAAA CC UA GGUGAUG A GU AGUGUAC C AAGUGAAGCACAACGAACA^ GU A CAA C GU - UUGAUAAGCUUAAGUUUUCUGCGUUUUACUUUGAUUAGAGCCGUACCU 200 190 180 170 160 150 140 130 120 110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dme-Mir-989_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGCCACUACCUUGCAGUCACGUG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dme-Mir-989_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0005506 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
122- UGUGAUGUGACGUAGUGGAACA -144
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005506 TargetScanFly: dme-miR-989 |
