MirGeneDB ID | Dme-Mir-976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-976 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dan-Mir-976 Dmo-Mir-976 Dsi-Mir-976 Dya-Mir-976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
X: 19558917-19558975 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-976) |
Mir-972
X: 19551171-19551226 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-973 X: 19551546-19551611 [+] UCSC Ensembl Mir-974 X: 19551702-19551763 [+] UCSC Ensembl Mir-2499 X: 19557029-19557090 [+] UCSC Ensembl Mir-975 X: 19558768-19558828 [+] UCSC Ensembl Mir-976 X: 19558917-19558975 [+] UCSC Ensembl Mir-977 X: 19559046-19559108 [+] UCSC Ensembl Mir-978-v1 X: 19561251-19561313 [+] UCSC Ensembl Mir-978-v2 X: 19561252-19561312 [+] UCSC Ensembl |
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Seed | UGGAUUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUGGUGGGCAUCGCCAUGCAGUGCCGCGGCAUUGGUGAGGCCAUCUCCAAUGGAUUAGUUCUCAACAUUGGAUUAGUUAUCAUCAAUGCCGGUGCACUGCACCUAACAACAUCGCGCCGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GUGGUGGGCAUCGCCAU--| CG GGCCAUC GAUUAG GCAGUGC CGGCAUUGGUGA UCCAAUG \ CGUCACG GCCGUAACUACU AGGUUAC U GCCGCGCUACAACAAUCCA^ UG AUUGAUU AACUCU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dme-Mir-976_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020873 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUUGGUGAGGCCAUCUCCAAUG -22
Get sequence
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Mature sequence | Dme-Mir-976_3p |
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mirBase accession | MIMAT0005492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- UUGGAUUAGUUAUCAUCAAUGC -59
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005492 TargetScanFly: dme-miR-976 |