MirGeneDB ID | Dme-Mir-932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-932 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-932 Aga-Mir-932 Bge-Mir-932 Dan-Mir-932 Dlo-Mir-932 Dmo-Mir-932 Dsi-Mir-932 Dya-Mir-932 Gpa-Mir-932 Hme-Mir-932 Tca-Mir-932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2L: 6902077-6902137 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAAUUCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUUCAAAAAGAGUAUUGGUUUUGAAGUUUUCAAUUCCGUAGUGCAUUGCAGUGUGUUUCAUUAUUUACUGCAAGCGCUGCGGAUUUGGCAACUUUGACGACCUUCAUCAUCUGCUAGAGAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 AUUUCAAAAAGAGUAUU- -|UG U U A GUGUUU GGUU U AAGUU UCAA UCCGUAGUGC UUGCAGU C CCAG A UUCAA GGUU AGGCGUCGCG AACGUCA A AGAGAUCGUCUACUACUU C^GU C U - UUUAUU . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dme-Mir-932_5p |
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mirBase accession | MIMAT0005479 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAAUUCCGUAGUGCAUUGCAGU -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0005479 TargetScanFly: dme-miR-932 |
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Star sequence | Dme-Mir-932_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0020860 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UGCAAGCGCUGCGGAUUUGGCA -61
Get sequence
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