| MirGeneDB ID | Cel-Mir-357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-357 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Roundworm (Caenorhabditis elegans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cel-mir-357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Cbr-Mir-357-P1 Cbr-Mir-357-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Caenorhabditis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (ce11) |
chrV: 8580565-8580627 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-357) |
Mir-357
chrV: 8580565-8580627 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-358-v1 chrV: 8580880-8580948 [-] UCSC Ensembl Mir-358-v2 chrV: 8580880-8580948 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | AAUGCCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUUUAACGCUGUACUACUCACCAGCGGAUCCCUACAACGCUGCGCAUAUGCAUGAACACAAUGAAAAUGUAAAUGCCAGUCGUUGCAGGAGUUCGCAUACAGUAGUAAAAUGCGCCCAAACGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UAUUUAACGCUGUACUACUCACCA-- UC A -| C A AUGAACAC GCGGA CCU CAACG CUG GCAU UGC \ CGCUU GGA GUUGC GAC CGUA AUG A GCAAACCCGCGUAAAAUGAUGACAUA GA C U^ - A UAAAAGUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Cel-Mir-357_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0020343 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCCUACAACGCUGCGCAUAUGC -22
Get sequence
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| Mature sequence | Cel-Mir-357_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0000699 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- AAAUGCCAGUCGUUGCAGGAGU -63
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000699 TargetScanWorm: cel-miR-357 |
