| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Em | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P2b1 | xla-mir-100-1 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0046409 | MIMAT0046411 | NC_030736.1 | 115939452 | 115939509 | - | X. laevis | Eumetazoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P2b2 | xla-mir-100-2 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0046409 | MIMAT0046410 | NW_016694862.1 | 484835 | 484892 | - | X. laevis | Eumetazoa | No | 1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P2c3 | None | MIR-10 | ACCCGUA | None | None | NC_030727.1 | 9127103 | 9127161 | - | X. laevis | Eumetazoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-10-P2c4 | xla-mir-99 | MIR-10 | ACCCGUA | MIMAT0046619 | MIMAT0046620 | NC_030726.1 | 26322951 | 26323009 | + | X. laevis | Eumetazoa | No | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
