Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-9-P1c | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_030728.1 | 99731313 | 99731374 | + | X. laevis | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-9-P1d | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_030729.1 | 44001647 | 44001708 | - | X. laevis | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-9-P2c | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_030724.1 | 182078649 | 182078707 | + | X. laevis | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-9-P2d | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_030725.1 | 151615023 | 151615081 | + | X. laevis | Bilateria | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-9-P3c | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_030738.1 | 109009154 | 109009215 | + | X. laevis | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-9-P3d | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_030739.1 | 93000179 | 93000240 | + | X. laevis | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-9-P4c | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NC_030724.1 | 110894599 | 110894658 | + | X. laevis | Bilateria | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Xla-Mir-9-P4d | None | MIR-9 | CUUUGGU | None | None | NW_016694812.1 | 1485278 | 1485337 | - | X. laevis | Bilateria | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all