| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-194-P2a | xla-mir-194 | MIR-194 | GUAACAG | MIMAT0011141 | None | NC_030732.1 | 14712976 | 14713030 | - | X. laevis | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-194-P2b | None | MIR-194 | GUAACAG | None | None | NC_030733.1 | 14167694 | 14167749 | + | X. laevis | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-194-P4c | xla-mir-194-2 | MIR-194 | GUAACAG | MIMAT0046508 | MIMAT0046509 | NC_030730.1 | 23104037 | 23104095 | + | X. laevis | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-194-P4d | None | MIR-194 | GUAACAG | None | None | NC_030731.1 | 2845927 | 2845985 | - | X. laevis | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
