| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▼ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Eg | Em | Em | He | Ki | Re | St | St | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-221-P2a4 | xla-mir-221 | MIR-221 | GCUACAU | MIMAT0046542 | MIMAT0046543 | NC_030727.1 | 44886234 | 44886296 | + | X. laevis | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-221-P2a3 | None | MIR-221 | GCUACAU | None | None | NC_030726.1 | 77927829 | 77927891 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-221-P1a4 | xla-mir-222 | MIR-221 | GCUACAU | MIMAT0046544 | MIMAT0046545 | NC_030727.1 | 44885774 | 44885835 | + | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Xla-Mir-221-P1a3 | None | MIR-221 | GCUACAU | None | None | NC_030726.1 | 77928376 | 77928437 | - | X. laevis | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
