| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-138-o1 | pma-mir-138a | MIR-138 | GCUGGUG | MIMAT0019469 | None | NC_046122.1 | 1115167 | 1115233 | - | P. marinus | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-138-o2 | None | MIR-138 | GCUGGUG | None | None | NC_046088.1 | 7504922 | 7504989 | + | P. marinus | Vertebrata | Yes | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-138-o3 | pma-mir-138b | MIR-138 | GCUGGUG | MIMAT0019470 | None | NC_046113.1 | 8496747 | 8496809 | + | P. marinus | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
