Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-181-P1o1 | pma-mir-181a | MIR-181 | ACAUUCA | MIMAT0019486 | MIMAT0019487 | NC_046090.1 | 2946536 | 2946600 | - | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-181-P1o2 | None | MIR-181 | ACAUUCA | None | None | NC_046118.1 | 4215267 | 4215339 | + | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-181-P2o1 | pma-mir-181b-1 | MIR-181 | ACAUUCA | MIMAT0019488 | MIMAT0019489 | NC_046090.1 | 2942239 | 2942311 | - | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pma-Mir-181-P2o2 | None | MIR-181 | ACAUUCA | None | None | NC_046118.1 | 4216042 | 4216102 | + | P. marinus | Vertebrata | Unknown | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all