| Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Br | Gi | Gu | He | Ki | La | Li | Mo | Mu | Sk | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-140-o1 | pma-mir-140 | MIR-140 | AGUGGUU | MIMAT0019471 | None | NC_046131.1 | 1629117 | 1629178 | - | P. marinus | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-140-o2 | None | MIR-140 | AGUGGUU | None | None | NC_046093.1 | 1829730 | 1829791 | - | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pma-Mir-140-o3 | None | MIR-140 | CCACAGG | None | None | PIZI01000964.1 | 4177 | 4240 | + | P. marinus | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all
