Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Li | Mi | Ov | Pe | Te | To | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-17-P1a | cli-mir-17 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0038421 | MIMAT0038422 | scaffold183 | 2837971 | 2838031 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-17-P1c | cli-mir-106 | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0038487 | MIMAT0038488 | scaffold72 | 3452469 | 3452526 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-17-P4a | cli-mir-20a | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0038432 | MIMAT0038433 | scaffold183 | 2837507 | 2837565 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cli-Mir-17-P4c | cli-mir-20b | MIR-17 | AAAGUGC | MIMAT0038434 | MIMAT0038435 | scaffold72 | 3452115 | 3452175 | - | Gnathostomata | Vertebrata | No | 1 | 1 |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all