Sort by genome coordinates | Motifs | Tissue expression
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MirGeneDB ID ▲ | MiRBase ID | Family | Seed | 5p accession | 3p accession | Chromosome | Start | End | Strand | Node of origin (locus) | Node of origin (family) | IsomiR | 3' NTU | UG | UGUG | CNNC | Ea | Ma | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Wh | Yo | Yo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cbr-Mir-54-P1a | cbr-mir-54a | MIR-54 | ACCCGUA | MIMAT0011477 | MIMAT0011478 | X | 16963777 | 16963838 | - | C. briggsae | Chromadorea | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cbr-Mir-54-P1b V | cbr-mir-54b | MIR-54 | CGAACCU | None | MIMAT0011494 | X | 16963615 | 16963679 | - | C. briggsae | Chromadorea | 2 | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cbr-Mir-54-P1c | cbr-mir-54d | MIR-54 | ACCCGUA | None | MIMAT0011496 | X | 16964087 | 16964152 | - | C. briggsae | Chromadorea | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cbr-Mir-54-P2 | cbr-mir-55 | MIR-54 | ACCCGUA | None | MIMAT0001310 | X | 16963478 | 16963540 | - | Caenorhabditis | Chromadorea | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cbr-Mir-54-P3 | cbr-mir-56 | MIR-54 | ACCCGUA | MIMAT0011475 | MIMAT0011476 | X | 16963349 | 16963415 | - | Caenorhabditis | Chromadorea | No |
(red - mature/co-mature, blue - star)
Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all