MirGeneDB

245 microRNA genes with node of origin D. rerio
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Dre-Let-7-P1a1 dre-let-7a-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr15 21437886 21437952 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1a2 dre-let-7a-4 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr5 29990466 29990532 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1b1 dre-let-7d-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001762 MIMAT0031931 chr16 24881136 24881205 + D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Let-7-P1b2 dre-let-7d-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001762 MIMAT0031931 chr19 9429867 9429936 + D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Let-7-P1c1 dre-let-7c-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001761 MIMAT0031930 chr15 29795845 29795911 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Let-7-P1c2 dre-let-7c-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001761 MIMAT0031930 chr10 38072088 38072154 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Let-7-P2a32 dre-let-7g-1 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001765 None chr23 18382468 18382538 - D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Let-7-P2a41 dre-let-7e LET-7 GAGGUAG None None chr23 5431431 5431503 - D. rerio Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2a31 dre-let-7g-2 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001765 None chr23 28536374 28536444 + D. rerio Bilateria Yes 1 1
Dre-Let-7-P2b31 dre-let-7h LET-7 GAGGUAG MIMAT0001766 None chr23 28536683 28536763 + D. rerio Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b41 dre-let-7a-5 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr23 5431216 5431292 - D. rerio Bilateria Yes 1
Dre-Let-7-P2b42 dre-let-7a-6 LET-7 GAGGUAG MIMAT0001759 None chr6 54506483 54506558 - D. rerio Bilateria Yes 1 1
Dre-Mir-1-P3a dre-mir-206-1 MIR-1 GGAAUGU MIMAT0031988 MIMAT0001866 chr20 19544667 19544726 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-1-P3b dre-mir-206-2 MIR-1 GGAAUGU None MIMAT0001866 chr17 5967262 5967321 - D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-7-o1 dre-mir-7a-3 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr8 10232 10295 + D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-7-P2a dre-mir-7a-1 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr25 12472469 12472532 + D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-7-P2b dre-mir-7a-2 MIR-7 GGAAGAC MIMAT0001266 None chr7 14450544 14450608 - D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P2a dre-mir-9-2 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr10 43535995 43536054 - D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P2b dre-mir-9-5 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr5 48170110 48170169 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-9-P3a dre-mir-9-6 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr7 14379556 14379617 - D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P3b dre-mir-9-3 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0003156 chr25 8551263 8551322 - D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-9-P4a dre-mir-9-4 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0031932 chr22 18254783 18254842 + D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-9-P4b dre-mir-9-7 MIR-9 CUUUGGU MIMAT0001769 MIMAT0031933 chr2 59102181 59102239 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-10-P1a1-v1 dre-mir-10a MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001267 MIMAT0003391 chr12 27134886 27134944 + D. rerio Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P1a1-v2 dre-mir-10a MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001267 MIMAT0003391 chr12 27134887 27134943 + D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1a2-v1 dre-mir-10c MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001770 MIMAT0031935 chr3 23720666 23720728 + D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1a2-v2 dre-mir-10c MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001770 MIMAT0031935 chr3 23720667 23720727 + D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1b1-v1 dre-mir-10b-1 MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001268 MIMAT0031919 chr9 1952963 1953024 - D. rerio Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P1b1-v2 dre-mir-10b-1 MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001268 MIMAT0031919 chr9 1952964 1953023 - D. rerio Eumetazoa No
Dre-Mir-10-P1b2-v1 dre-mir-10d MIR-10 ACCCUGU MIMAT0001771 MIMAT0003394 chr6 10867051 10867112 + D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P1b2-v2 dre-mir-10d MIR-10 CCCUGUA MIMAT0001771 MIMAT0003394 chr6 10867052 10867111 + D. rerio Eumetazoa No
Dre-Mir-10-P2a1 dre-mir-100-1 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001813 MIMAT0031957 chr15 21437656 21437712 + D. rerio Eumetazoa No 1 1 1
Dre-Mir-10-P2a2 dre-mir-100-2 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001813 MIMAT0031958 chr5 29990157 29990213 + D. rerio Eumetazoa No 1 1 1
Dre-Mir-10-P2c1 dre-mir-99-1 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001812 None chr15 29795596 29795655 + D. rerio Eumetazoa No
Dre-Mir-10-P2c2 dre-mir-99-2 MIR-10 ACCCGUA MIMAT0001812 None chr10 38074321 38074380 - D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3a1 dre-mir-125b-1 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031963 chr15 21447701 21447762 + D. rerio Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P3a2 dre-mir-125b-2 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031964 chr5 29998775 29998836 + D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3b1 dre-mir-125a-1 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001820 None chr16 24898184 24898242 + D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3b2 dre-mir-125a-2 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001820 None chr19 9443800 9443858 + D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-10-P3c1 dre-mir-125c MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001822 MIMAT0031966 chr15 29800981 29801041 + D. rerio Eumetazoa No 1 1
Dre-Mir-10-P3c2 dre-mir-125b-3 MIR-10 CCCUGAG MIMAT0001821 MIMAT0031965 chr10 38051674 38051736 - D. rerio Eumetazoa No 1
Dre-Mir-15-P1a1 dre-mir-15a-1 MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001772 MIMAT0003395 chr1 46722633 46722692 - D. rerio Olfactores No
Dre-Mir-15-P1a2 dre-mir-15a-2 MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001772 None chr9 29652531 29652588 - D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2a1 dre-mir-16b MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001775 None chr1 46722416 46722480 - D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-15-P2a2 dre-mir-16c MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001776 MIMAT0031937 chr9 29652389 29652453 - D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-17-P1a1 dre-mir-17a-1 MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001777 MIMAT0003396 chr1 3298149 3298209 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P1a2 dre-mir-17a-2 MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001777 MIMAT0031938 chr9 53436955 53437013 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P2a1 dre-mir-18a MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001779 None chr1 3298014 3298078 - D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-17-P2a2 dre-mir-18b MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001780 MIMAT0003397 chr9 53436841 53436905 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P2b1 dre-mir-18c MIR-17 AAGGUGC MIMAT0001781 None chr14 31467386 31467450 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P3a1 dre-mir-20a MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001786 MIMAT0003400 chr1 3297646 3297705 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-17-P3b1 dre-mir-20b MIR-17 AAAGUGC MIMAT0001778 MIMAT0031939 chr14 31467183 31467241 - D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-19-P1a dre-mir-19a MIR-19 GUGCAAA MIMAT0003398 MIMAT0001782 chr1 3297862 3297919 - D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-19-P2a1 dre-mir-19b MIR-19 GUGCAAA MIMAT0003399 MIMAT0001783 chr1 3297494 3297555 - D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-19-P2b1 dre-mir-19c MIR-19 GUGCAAA MIMAT0031940 MIMAT0001784 chr14 31467045 31467105 - D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-21-P1 dre-mir-21-1 MIR-21 AGCUUAU MIMAT0001787 None chr10 28198933 28198993 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-21-P2 dre-mir-21-2 MIR-21 AGCUUAU MIMAT0001787 None chr15 17373822 17373880 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-23-P2a dre-mir-23b MIR-23 UCACAUU None MIMAT0001791 chr10 15954588 15954651 + D. rerio Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-23-P2b dre-mir-23b-2 MIR-23 UCACAUU MIMAT0048660 MIMAT0048661 chr8 30167636 30167695 - D. rerio Vertebrata Yes 1 1
Dre-Mir-24-P2a dre-mir-24-1 MIR-24 GGCUCAG None MIMAT0001792 chr10 15960848 15960904 + D. rerio Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-24-P2b dre-mir-24-3 MIR-24 GCCUACU None MIMAT0001792 chr8 30162533 30162589 - D. rerio Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-26-P3a dre-mir-26a-2 MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001794 MIMAT0031948 chr2 21375503 21375560 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-26-P3b dre-mir-26a-3 MIR-26 UCAAGUA MIMAT0001794 None chr24 20470992 20471052 - D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-27-P2a dre-mir-27d MIR-27 UCACAGU None MIMAT0001799 chr10 15954740 15954804 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-27-P2b dre-mir-27b MIR-27 UCACAGU MIMAT0031950 MIMAT0001797 chr8 30167449 30167508 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-29-P2b1 dre-mir-29b-1 MIR-29 CUGAAUU None MIMAT0001801 chr6 47467922 47467983 + D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-29-P2b2 dre-mir-29b3 MIR-29 AGCACCA MIMAT0048667 MIMAT0048668 chr23 32440125 32440189 - D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-30-P1o1 dre-mir-30a MIR-30 GUAAACA MIMAT0001803 MIMAT0031951 chr19 4737589 4737653 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-92-P1a1 dre-mir-92a-1 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031953 MIMAT0001808 chr1 3297377 3297435 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-92-P1a2 dre-mir-92a-2 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031954 MIMAT0001808 chr9 53436299 53436355 - D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-92-P1c1 dre-mir-92b MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031955 MIMAT0001809 chr16 42898443 42898505 + D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-92-P2b1 dre-mir-363 MIR-92 AUUGCAC MIMAT0031992 MIMAT0001874 chr14 31466699 31466769 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-103-P3a dre-mir-107a MIR-103 GCAGCAU MIMAT0031959 MIMAT0001817 chr12 16960706 16960765 + D. rerio Deuterostomia No 1
Dre-Mir-103-P3b dre-mir-107b MIR-103 GCAGCAU None MIMAT0011301 chr17 23573143 23573202 + D. rerio Deuterostomia No 1
Dre-Mir-124-P2a-v1 dre-mir-124-1 MIR-124 AAGGCAC None MIMAT0001819 chr2 26645327 26645385 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P2a-v2 dre-mir-124-1 MIR-124 UAAGGCA None MIMAT0001819 chr2 26645328 26645385 - D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-124-P2b-v1 dre-mir-124-3 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr24 24455662 24455720 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P2b-v2 dre-mir-124-3 MIR-124 UAAGGCA MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr24 24455662 24455719 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P3a-v1 dre-mir-124-5 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr23 17783451 17783510 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P3a-v2 dre-mir-124-5 MIR-124 UAAGGCA MIMAT0031960 MIMAT0001819 chr23 17783451 17783509 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P3b-v1 dre-mir-124-6 MIR-124 AAGGCAC MIMAT0031962 MIMAT0001819 chr8 23122788 23122847 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-124-P3b-v2 dre-mir-124-6 MIR-124 UAAGGCA MIMAT0031962 MIMAT0001819 chr8 23122789 23122847 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-126-P1-v1 dre-mir-126a MIR-126 AUUAUUA MIMAT0003157 MIMAT0001823 chr8 11548435 11548494 - D. rerio Olfactores No
Dre-Mir-126-P1-v2 dre-mir-126a MIR-126 CGUACCG MIMAT0003157 MIMAT0001823 chr8 11548435 11548494 - D. rerio Olfactores No
Dre-Mir-126-P1-v3 dre-mir-126a MIR-126 UCGUACC MIMAT0003157 MIMAT0001823 chr8 11548435 11548494 - D. rerio Olfactores No
Dre-Mir-126-P2-v1 dre-mir-126b MIR-126 AUUAUUA MIMAT0011307 MIMAT0011306 chr21 7240249 7240307 - D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-126-P2-v2 dre-mir-126b MIR-126 CGUACCG MIMAT0011307 MIMAT0011306 chr21 7240249 7240307 - D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-126-P2-v3 dre-mir-126b MIR-126 UCGUACC MIMAT0011307 MIMAT0011306 chr21 7240249 7240307 - D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-128-P1a dre-mir-128-1 MIR-128 CACAGUG MIMAT0031967 MIMAT0001824 chr22 12374807 12374865 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-128-P1b dre-mir-128-3 MIR-128 CACAGUG MIMAT0048666 MIMAT0001824 chrUn_KN150366v1 5637 5693 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-129-P1a dre-mir-129-1 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0031968 chr4 19047477 19047542 - D. rerio Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-129-P1b dre-mir-129-3 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0048649 chr18 10670670 10670735 + D. rerio Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-129-P2a dre-mir-129-2 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0003158 chr7 50287944 50288006 - D. rerio Chordata No 1 1
Dre-Mir-129-P2b dre-mir-129-4 MIR-129 UUUUUGC MIMAT0001825 MIMAT0003158 chr25 30176484 30176548 + D. rerio Chordata No 1 1 1
Dre-Mir-130-P1b1 dre-mir-130b MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001827 chr5 13299343 13299404 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-130-P2a1 dre-mir-301a MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001870 chr10 33377014 33377073 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-130-P2b1 dre-mir-301b MIR-130 CUUUGAC MIMAT0031990 MIMAT0001871 chr5 13289363 13289425 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-130-P2b2 dre-mir-301c MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031991 MIMAT0001872 chr10 17454501 17454563 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-130-P3a1 dre-mir-130a MIR-130 AGUGCAA None MIMAT0001826 chr10 33377140 33377202 - D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-130-P3b1 dre-mir-130c-1 MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031969 MIMAT0001828 chr10 17453405 17453463 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-130-P3b2 dre-mir-130c-2 MIR-130 AGUGCAA MIMAT0031969 MIMAT0001828 chr5 13288840 13288898 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-132-P1a dre-mir-132-1 MIR-132 AACAGUC MIMAT0003403 MIMAT0001829 chr15 25897727 25897789 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P1b dre-mir-132-2 MIR-132 AACAGUC None MIMAT0001829 chr10 35645043 35645103 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P2a dre-mir-212 MIR-132 CCUUGGC None MIMAT0003049 chr15 25897460 25897528 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-132-P2b dre-mir-212-2 MIR-132 CCUUGGC MIMAT0048650 MIMAT0048651 chr10 35644719 35644787 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-133-P3a-v1 dre-mir-133b MIR-133 UUGGUCC MIMAT0003405 MIMAT0001831 chr20 19543389 19543448 - D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-133-P3a-v2 dre-mir-133b MIR-133 UGGUCCC MIMAT0003405 MIMAT0001831 chr20 19543389 19543448 - D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-133-P3b-v1 dre-mir-133c MIR-133 UUGGUCC MIMAT0031971 MIMAT0001832 chr17 5962990 5963049 - D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-133-P3b-v2 dre-mir-133c MIR-133 UGGUCCC MIMAT0031971 MIMAT0001832 chr17 5962990 5963049 - D. rerio Bilateria No
Dre-Mir-135-P3a dre-mir-135c-1 MIR-135 AUGGCUU MIMAT0001833 None chr11 38175079 38175140 - D. rerio Chordata No 1
Dre-Mir-135-P3b dre-mir-135c-2 MIR-135 AUGGCUU MIMAT0001833 None chr23 18063203 18063264 - D. rerio Chordata No 1
Dre-Mir-137-P1a-v1 dre-mir-137-1 MIR-137 UAUUGCU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr2 20145753 20145811 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-137-P1a-v2 dre-mir-137-1 MIR-137 AUUGCUU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr2 20145752 20145811 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-137-P1b-v1 dre-mir-137-2 MIR-137 UAUUGCU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr24 30352646 30352704 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-137-P1b-v2 dre-mir-137-2 MIR-137 AUUGCUU MIMAT0031972 MIMAT0001834 chr24 30352646 30352705 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-142-P1-v1 dre-mir-142a MIR-142 AUAAAGU MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170753 3170812 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P1-v2 dre-mir-142a MIR-142 AUAAAGU MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170753 3170812 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P1-v3 dre-mir-142a MIR-142 GUAGUGU MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170753 3170812 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P1-v4 dre-mir-142a MIR-142 CCAUAAA MIMAT0001838 MIMAT0003160 chr5 3170751 3170814 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-142-P2-v1 dre-mir-142b MIR-142 AUAAAGU MIMAT0001839 None chr15 15383910 15383969 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P2-v2 dre-mir-142b MIR-142 UAGUGUU MIMAT0001839 None chr15 15383910 15383969 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-142-P2-v3 dre-mir-142b MIR-142 GUAGUGU MIMAT0001839 None chr15 15383910 15383969 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-153-P1a dre-mir-153b MIR-153 UCAUUUU MIMAT0031977 MIMAT0001848 chr6 13980987 13981046 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-153-P1b dre-mir-153c MIR-153 UGCAUAG MIMAT0031979 MIMAT0001850 chr9 7612418 7612477 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-181-P1a1 dre-mir-181a-1 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0001282 chr22 22826011 22826074 - D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-181-P1a2 dre-mir-181a-4 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048653 chr21 8221816 8221875 - D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-181-P1c1 dre-mir-181a-3 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048654 chr3 34197460 34197519 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-181-P1c2 dre-mir-181a-5 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001623 MIMAT0048655 chr2 45204644 45204703 - D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-181-P2a1 dre-mir-181b-3 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 MIMAT0048656 chr22 22825804 22825864 - D. rerio Vertebrata Yes 1
Dre-Mir-181-P2b1 dre-mir-181d MIR-181 ACAUUCA MIMAT0048657 MIMAT0048658 chr21 8221671 8221730 - D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-181-P2b2 dre-mir-181b-2 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 MIMAT0031920 chr8 53023694 53023753 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-181-P2c1 dre-mir-181b-1 MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001270 None chr2 45202237 45202295 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-181-P2c2 dre-mir-181c MIR-181 ACAUUCA MIMAT0001852 MIMAT0031980 chr3 34197705 34197762 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-184-P1 dre-mir-184-1 MIR-184 GGACGGA None MIMAT0001853 chr18 26203314 26203376 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-184-P2 dre-mir-184-2 MIR-184 GGACGGA None MIMAT0001853 chr7 30189601 30189663 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P1a1 dre-mir-193a-1 MIR-193 ACUGGCC MIMAT0031981 MIMAT0001856 chr3 35959932 35959993 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P1a2 dre-mir-193a-2 MIR-193 ACUGGCC MIMAT0031981 MIMAT0001856 chr6 18517992 18518050 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P2a1 dre-mir-365-2 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr3 35961006 35961067 + D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P2a2 dre-mir-365-3 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr6 18516330 18516391 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-193-P2b1 dre-mir-365-1 MIR-193 AAUGCCC None MIMAT0001875 chr3 43716841 43716901 + D. rerio Bilateria Yes 1
Dre-Mir-194-P1a dre-mir-194a MIR-194 GUAACAG MIMAT0001858 None chr10 27063188 27063244 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-194-P1b dre-mir-194b MIR-194 GUAACAG MIMAT0001859 None LKPD01021295.1 6148 6206 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-196-P2a dre-mir-196a-1 MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001276 None chr23 36088111 36088169 + D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P2b dre-mir-196c MIR-196 AGGUAGU MIMAT0011298 None chr11 2190643 2190701 + D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P3a dre-mir-196a-2 MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001276 MIMAT0031983 chr19 19747629 19747686 + D. rerio Olfactores No 1
Dre-Mir-196-P3b dre-mir-196d MIR-196 AGGUAGU MIMAT0011313 None chr16 20913420 20913478 + D. rerio Olfactores No
Dre-Mir-203-P1-v1 dre-mir-203a MIR-203 UGAAAUG MIMAT0031923 MIMAT0001278 chr17 45808184 45808243 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-203-P1-v2 dre-mir-203a MIR-203 GAAAUGU MIMAT0031923 MIMAT0001278 chr17 45808184 45808243 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-203-P2-v1 dre-mir-203b MIR-203 UGAAAUG MIMAT0003407 MIMAT0001865 chr20 27405891 27405949 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-203-P2-v2 dre-mir-203b MIR-203 GAAAUGU MIMAT0003407 MIMAT0001865 chr20 27405891 27405949 + D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-204-P2a dre-mir-204-2 MIR-204 UCCCUUU MIMAT0001279 MIMAT0031987 chr7 29337026 29337083 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-204-P2b dre-mir-204-3 MIR-204 UCCCUUU MIMAT0001279 MIMAT0048659 chr25 34590805 34590862 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-219-P1a dre-mir-219-3 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 MIMAT0031989 chr19 18861780 18861840 - D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-219-P2a dre-mir-219-1 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 None chr10 10329476 10329540 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-219-P2b dre-mir-219-2 MIR-219 GAUUGUC MIMAT0001286 None chr5 65101371 65101437 + D. rerio Bilateria No 1 1
Dre-Mir-221-P1a dre-mir-221 MIR-221 GCUACAU MIMAT0031926 MIMAT0001288 chr9 33920955 33921017 - D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-221-P2a dre-mir-222a MIR-221 GCUCAGU MIMAT0031927 MIMAT0001289 chr9 33921481 33921542 - D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-338-P1a dre-mir-338-1 MIR-338 CCAGCAU None MIMAT0001873 chr12 35710532 35710592 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-338-P1b dre-mir-338-3 MIR-338 CCAGCAU MIMAT0048672 MIMAT0048673 chr3 51907489 51907549 - D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-375-P1 dre-mir-375-1 MIR-375 UUGUUCG None MIMAT0001876 chr6 13800103 13800160 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-375-P2 dre-mir-375-2 MIR-375 UUGUUCG None MIMAT0001876 chr9 11571983 11572043 - D. rerio Bilateria No 1
Dre-Mir-430-o1a dre-mir-430a-1 MIR-430 AAGUGCU None MIMAT0001423 chr10 4493289 4493347 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b1 dre-mir-430a-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28694962 28695020 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b2 dre-mir-430a-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28696703 28696761 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b3 dre-mir-430a-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28699047 28699105 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b4 dre-mir-430a-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28700810 28700868 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b5 dre-mir-430a-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28708442 28708500 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b6 dre-mir-430a-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28706702 28706760 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b7 dre-mir-430a-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28703199 28703257 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1b8 dre-mir-430a-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031994 MIMAT0001423 chr4 28703199 28703257 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1c dre-mir-430a-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031996 MIMAT0001423 chr4 28701436 28701494 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d1 dre-mir-430a-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031995 MIMAT0001423 chr4 28693846 28693904 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d2 dre-mir-430a-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031997 MIMAT0001423 chr4 28695588 28695646 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d3 dre-mir-430a-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031998 MIMAT0001423 chr4 28697329 28697387 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d4 dre-mir-430a-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031999 MIMAT0001423 chr4 28697933 28697991 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d5 dre-mir-430a-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032000 MIMAT0001423 chr4 28703825 28703883 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d6 dre-mir-430a-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032001 MIMAT0001423 chr4 28709068 28709126 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1d7 dre-mir-430a-17 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032002 MIMAT0001423 chr4 28707328 28707386 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e1 dre-mir-430i-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28699673 28699732 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e2 dre-mir-430i-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28702062 28702121 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o1e3 dre-mir-430i-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0032003 MIMAT0001880 chr4 28705565 28705624 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a1 dre-mir-430b-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28694231 28694289 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a2 dre-mir-430b-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28695382 28695440 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a3 dre-mir-430b-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28695972 28696030 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a4 dre-mir-430b-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28697727 28697785 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a5 dre-mir-430b-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28699467 28699525 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a6 dre-mir-430b-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28700079 28700137 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a7 dre-mir-430b-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28701856 28701914 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a8 dre-mir-430b-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28709466 28709524 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a9 dre-mir-430b-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28707712 28707770 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a10 dre-mir-430b-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28707122 28707180 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a11 dre-mir-430b-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28705971 28706029 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a12 dre-mir-430b-17 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28705359 28705417 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a13 dre-mir-430b-18 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28703619 28703677 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2a14 dre-mir-430b-19 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28702468 28702526 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2b dre-mir-430b-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28693640 28693698 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c1 dre-mir-430b-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28697123 28697181 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c2 dre-mir-430b-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28701230 28701288 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2c3 dre-mir-430b-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28708862 28708920 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2d1 dre-mir-430b-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28698317 28698375 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o2d2 dre-mir-430b-20 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031928 MIMAT0001424 chr4 28704209 28704267 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-430-o3a1 dre-mir-430c-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28693379 28693437 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a2 dre-mir-430c-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28693983 28694041 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a3 dre-mir-430c-3 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28695121 28695179 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a4 dre-mir-430c-4 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28695725 28695783 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a5 dre-mir-430c-5 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28696862 28696920 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a6 dre-mir-430c-6 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28697466 28697524 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a7 dre-mir-430c-7 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28699206 28699264 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a8 dre-mir-430c-8 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28709205 28709263 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a9 dre-mir-430c-9 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28708601 28708659 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a10 dre-mir-430c-10 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28707465 28707523 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a11 dre-mir-430c-11 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28706861 28706919 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a12 dre-mir-430c-12 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28705724 28705782 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a13 dre-mir-430c-13 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28702221 28702279 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a14 dre-mir-430c-14 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28701595 28701653 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a15 dre-mir-430c-15 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28700969 28701027 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3a16 dre-mir-430c-16 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0031929 MIMAT0001425 chr4 28699832 28699890 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3b1 None MIR-430 AAGUGCU None None chr4 28698070 28698128 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-430-o3b2 None MIR-430 AAGUGCU None None chr4 28703962 28704020 + D. rerio Vertebrata No 1 1
Dre-Mir-455-P1 dre-mir-455-1 MIR-455 AUGUGCC MIMAT0001879 MIMAT0031993 chr5 65250401 65250459 - D. rerio Vertebrata No
Dre-Mir-455-P2 dre-mir-455-2 MIR-455 AUGUGCC MIMAT0011302 MIMAT0031993 chr16 51776559 51776617 + D. rerio Vertebrata No 1
Dre-Mir-722 dre-mir-722 MIR-722 UUUGCAG None MIMAT0003748 chr1 56363896 56363960 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Mir-723 dre-mir-723 MIR-723 GACAUCA MIMAT0003750 MIMAT0003751 chrUn_KN149706v1 28040 28100 - D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-724 dre-mir-724 MIR-724 UAAAGGG MIMAT0003752 None chr11 3176699 3176759 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-728 dre-mir-728 MIR-728 UACUAAG None MIMAT0003757 chr24 26190564 26190624 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-729 dre-mir-729 MIR-729 AUGGGUA None MIMAT0003758 chr4 13584505 13584565 + D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-732 dre-mir-732 MIR-732 UCAAAGC None MIMAT0003762 chr9 41682940 41682998 + D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-734 dre-mir-734 MIR-734 AAAUGCU None MIMAT0003765 chr1 34122893 34122961 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-2184-P1 dre-mir-2184 MIR-2184 ACAGUAA MIMAT0011288 None chr10 35654276 35654332 - D. rerio Gnathostomata No 1 1
Dre-Mir-2184-P2 None MIR-2184 ACAGUAA None None LKPD01047922.1 7188 7244 + D. rerio Gnathostomata No 1 1
Dre-Mir-2187 dre-mir-2187 MIR-2187 UAAUUAG MIMAT0011296 MIMAT0011297 chr17 19900776 19900836 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Mir-2189 dre-mir-2189 MIR-2189 GAUUGUU None MIMAT0011311 chrUn_KN150127v1 17180 17237 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-2191 dre-mir-2191 MIR-2191 CACACCU None MIMAT0011300 chr23 36790250 36790310 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-7132 dre-mir-7132 MIR-7132 ACUUGGU MIMAT0048669 MIMAT0048670 chr3 59063772 59063829 + D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Mir-7133 dre-mir-7133 MIR-7133 AGUUUGA MIMAT0048664 MIMAT0048665 chr8 10020272 10020332 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Mir-7148 dre-mir-7148 MIR-7148 AUGGAAA MIMAT0028206 MIMAT0028207 chr2 57103411 57103473 - D. rerio D. rerio No
Dre-Mir-7149 dre-mir-7149 MIR-7149 UCCAAGU MIMAT0028208 MIMAT0028209 chr23 24074089 24074151 + D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-1 None DRE-NOVEL-1 AUUUUCU None None chr18 15584378 15584438 - D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-2 None DRE-NOVEL-2 UAUGUGU None None chr19 6275796 6275851 - D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-3 None DRE-NOVEL-3 CUGAUCA None None chr17 52860985 52861045 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-4 None DRE-NOVEL-4 CAGGAAU None None chr15 37725346 37725406 - D. rerio D. rerio No
Dre-Novel-5 None DRE-NOVEL-5 CAUGUCA None None chr9 56359312 56359379 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Novel-6 None DRE-NOVEL-6 ACAAGGG None None chr3 26193747 26193808 + D. rerio D. rerio No 1
Dre-Novel-7 None DRE-NOVEL-7 GGGCGAU None None chr22 364003 364066 - D. rerio D. rerio No 1 1
Dre-Novel-8 None DRE-NOVEL-8 AAAUAAU None None chr4 6920268 6920338 + D. rerio D. rerio No 1 1

Get sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all