MirGeneDB 3.0

34 microRNA genes with node of origin G. gallus

						Sort by genome coordinates								Motifs
MirGeneDB ID ▲	MiRBase ID	Family	Seed	5p accession	3p accession	Chromosome	Start	End	Strand	Node of origin (locus)	Node of origin (family)	Iso­miR	3' NTU	UG	UGUG	CNNC
Gga-Mir-7-P2c	gga-mir-7-1	MIR-7	GGAAGAC	MIMAT0001157	None	Z	40089600	40089663	-	G. gallus	Bilateria		No			1
Gga-Mir-7-P2d	gga-mir-7b	MIR-7	GGAAGAC	MIMAT0001192	None	W	4705187	4705251	-	G. gallus	Bilateria		No			1
Gga-Mir-122-P1	gga-mir-122-1	MIR-122	GGAGUGU	MIMAT0001190	MIMAT0026550	Z	761062	761119	+	G. gallus	Vertebrata		No	1	1	1
Gga-Mir-122-P2	gga-mir-122-2	MIR-122	GGAGUGU	MIMAT0001190	MIMAT0026550	W	2916998	2917055	-	G. gallus	Vertebrata		No		1	1
Gga-Mir-1452	gga-mir-1452	MIR-1452	UGAGAUA	MIMAT0007328	None	Z	66646493	66646555	+	G. gallus	G. gallus		No	1
Gga-Mir-1550	gga-mir-1550	MIR-1550	GAUGGGG	MIMAT0007403	MIMAT0007404	12	13251466	13251522	+	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1551	gga-mir-1551	MIR-1551	UAGCAGC	MIMAT0007405	MIMAT0007406	14	5612819	5612882	+	G. gallus	G. gallus		No		1	1
Gga-Mir-1553	gga-mir-1553	MIR-1553	GUGGUGG	MIMAT0007409	MIMAT0007410	7	23744593	23744649	+	G. gallus	G. gallus		No			1
Gga-Mir-1555	gga-mir-1555	MIR-1555	AGGGUUA	MIMAT0026774	MIMAT0007412	1	146371379	146371439	-	G. gallus	G. gallus		No		1
Gga-Mir-1560	gga-mir-1560	MIR-1560	GCAUCUC	MIMAT0007417	MIMAT0007418	11	18630380	18630438	-	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1591	gga-mir-1591	MIR-1591	GAUUCAU	MIMAT0007453	MIMAT0007454	7	19311636	19311696	-	G. gallus	G. gallus		No			1
Gga-Mir-1596	gga-mir-1596	MIR-1596	UUCUCCU	MIMAT0007460	MIMAT0007461	1	6347558	6347621	+	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1601	gga-mir-1601	MIR-1601	GCUCUGC	None	MIMAT0007467	24	2042406	2042470	+	G. gallus	G. gallus		No			1
Gga-Mir-1618	gga-mir-1618	MIR-1618	GAGCCCG	MIMAT0026776	MIMAT0007485	8	7822239	7822298	+	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1651	gga-mir-1651	MIR-1651	UGCUUUU	MIMAT0007529	MIMAT0007530	1	1178478	1178535	+	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1663	gga-mir-1663	MIR-1663	ACCGCUG	MIMAT0007544	MIMAT0007545	5	16028827	16028883	+	G. gallus	G. gallus		No			1
Gga-Mir-1668	gga-mir-1668	MIR-1668	GCUGUGU	MIMAT0007551	MIMAT0007552	33	5702513	5702569	-	G. gallus	G. gallus		No		1
Gga-Mir-1669	gga-mir-1669	MIR-1669	UGGGCUC	None	MIMAT0007553	26	3626810	3626871	+	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1677-P3	gga-mir-1744	MIR-1677	CUUCAAC	MIMAT0007648	MIMAT0007649	10	10362855	10362917	+	G. gallus	Diapsida		No
Gga-Mir-1685	gga-mir-1685	MIR-1685	CAGUAAU	MIMAT0007573	MIMAT0007574	2	24783243	24783306	+	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1689	gga-mir-1689	MIR-1689	CGGUGAC	MIMAT0007579	MIMAT0007580	19	9540181	9540243	-	G. gallus	G. gallus		No			1
Gga-Mir-1728	gga-mir-1728	MIR-1728	GGCUUCU	MIMAT0007627	MIMAT0007628	4	10929477	10929544	-	G. gallus	G. gallus		No	1
Gga-Mir-1731	gga-mir-1731	MIR-1731	CUUGACU	MIMAT0007633	MIMAT0026780	12	11048722	11048777	-	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1736	gga-mir-1736	MIR-1736	GCACCUU	MIMAT0007638	MIMAT0007639	1	140535089	140535155	-	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-1751	gga-mir-1751	MIR-1751	UGAAGGA	MIMAT0007658	None	4	50089462	50089525	+	G. gallus	G. gallus		No			1
Gga-Mir-1774	gga-mir-1774	MIR-1774	CCCUGCU	None	MIMAT0007685	28	1464741	1464800	+	G. gallus	G. gallus		No			1
Gga-Mir-1806	gga-mir-1806	MIR-1806	GGCAGGA	None	MIMAT0007724	1	95234304	95234363	-	G. gallus	G. gallus		No			1
Gga-Mir-7441	gga-mir-7441	MIR-7441	UGAGGAG	MIMAT0029036	MIMAT0029037	17	2437879	2437941	+	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-7462	gga-mir-7462	MIR-7462	AACCUCA	MIMAT0029078	MIMAT0029079	3	54227861	54227921	+	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-10585	gga-mir-10585	MIR-10585	GAUGAAA	MIMAT0049964	MIMAT0049965	2	473003	473062	+	G. gallus	G. gallus		No	1		1
Gga-Mir-12223	gga-mir-12223	MIR-12223	AGUUCAG	MIMAT0049923	MIMAT0049924	13	17776577	17776631	-	G. gallus	G. gallus		No
Gga-Mir-12246	gga-mir-12246	MIR-12246	UGGGUGG	MIMAT0049981	MIMAT0049982	21	5009985	5010042	-	G. gallus	G. gallus		No	1
Gga-Mir-12265	gga-mir-12265	MIR-12265	UGGCUGU	MIMAT0050020	MIMAT0050021	3	96496738	96496796	-	G. gallus	G. gallus		No		1
Gga-Mir-12277	gga-mir-12277	MIR-12277	UUGGGUG	MIMAT0050048	MIMAT0050049	5	348189	348254	+	G. gallus	G. gallus		No	1

(red - mature/co-mature, blue - star)

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all