MirGeneDB ID | Tgu-Mir-7463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7463 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Zebra finch (Taeniopygia guttata) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-7463 Cli-Mir-7463 Cpi-Mir-7463 Gga-Mir-7463 Spt-Mir-7463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Diapsida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Diapsida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (TaeGut1_add) |
3: 86792314-86792375 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUACUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAAUACCAUGUUAUUAUGGAUAGUAUAGACUGAGUCUCCUUGAAAGUAAUGGCAUGUGAUUGCUUACCCCAUUACUUUCAAUGGGACUAAGUCUAUGUCAUCCUUAGGGACUCCAUCCCAUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UAAUACCAUGUUAUUAU--| AG G C CAUGUGA GGAU UAUAGACU AGUCUC UUGAAAGUAAUGG U CCUA GUAUCUGA UCAGGG AACUUUCAUUACC U UUACCCUACCUCAGGGAUU^ CU A U CCAUUCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Tgu-Mir-7463_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGUCUCCUUGAAAGUAAUGG -22
Get sequence
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Mature sequence | Tgu-Mir-7463_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- AUUACUUUCAAUGGGACUAAGU -62
Get sequence
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