MirGeneDB ID | Ami-Mir-7463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7463 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | American alligator (Alligator mississippiensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cli-Mir-7463 Cpi-Mir-7463 Gga-Mir-7463 Spt-Mir-7463 Tgu-Mir-7463 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Diapsida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Diapsida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_000281125.3_ASM28112v4_AMI_add) |
NW_017713592.1: 5259115-5259176 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UUACUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UAUUACCAUGUUAUUAUGGAUAGUAUAGACUGAGUCUCCUUGAAAGUAAUGGCAUGUGAUUGCUUACCCCAUUACUUUCAAUGGGACUAAGUCUAUGUCAUCCUUAGGGACUCAAUCCCAUUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UAUUACCAUGUUAUUAU--| AG G C CAUGUGA GGAU UAUAGACU AGUCUC UUGAAAGUAAUGG U CCUA GUAUCUGA UCAGGG AACUUUCAUUACC U UUACCCUAACUCAGGGAUU^ CU A U CCAUUCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Ami-Mir-7463_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGAGUCUCCUUGAAAGUAAUGG -22
Get sequence
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Mature sequence | Ami-Mir-7463_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- AUUACUUUCAAUGGGACUAAGU -62
Get sequence
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