| MirGeneDB ID | Pbv-Mir-430-o37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Burmese python (Python bivittatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pbv-Mir-430-o36 Pbv-Mir-430-o38 Pbv-Mir-430-o39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-430-P37a Hsa-Mir-430-P37b Hsa-Mir-430-P37c Pab-Mir-430-P37a Pab-Mir-430-P37b Pab-Mir-430-P37c | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | P. bivittatus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus) |
KE954489.1: 53544-53603 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-o37) |
Mir-430-o36
KE954489.1: 53193-53254 [+]
Mir-430-o37 KE954489.1: 53544-53603 [+] Mir-430-o38 KE954489.1: 53677-53737 [+] Mir-430-o39 KE954489.1: 53802-53862 [+] |
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| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGCUUCCAUCUCUCACUGACUGAGCCUUGCCCAGACAUGGGCACUUUUCUUUUUUUCUAAUCUGGAAAGUGCUUCAUUGUUUGGGUGAGGCUCUGGUUCAGGUUCCCUCUAAAUUGGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGAGCUUCCAUCUCUCACU- - UG - -| UUUUUU GACU GAGCCU CCCAGAC AUG GGCACUUUUC U UUGG CUCGGA GGGUUUG UAC UCGUGAAAGG C AGGUUAAAUCUCCCUUGGAC U GU U U^ UCUAAU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pbv-Mir-430-o37_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GCCCAGACAUGGGCACUUUUC -21
Get sequence
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| Mature sequence | Pbv-Mir-430-o37_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- AAAGUGCUUCAUUGUUUGGGUGA -60
Get sequence
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