| MirGeneDB ID | Pbv-Mir-203 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-203 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Burmese python (Python bivittatus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | pbv-mir-203 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pbv-Mir-203-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Lch-Mir-203 Spt-Mir-203 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus) |
KE953268.1: 83997-84056 [-] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-203-v2) |
Mir-203-v1
KE953268.1: 83997-84056 [-]
Mir-203-v2 KE953268.1: 83997-84056 [-] |
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| Variant | Pbv-Mir-203-v2 |
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| Seed | GAAAUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAUCCGAGCUCUCUCAGCCUGCUGGGUGCAGUGGUUCUUAACAGUUCAACAGUUCUGUAGCAUAAUUGUGAAAUGUUUAGGACCACUUGAUCCGGACGGCUUGCGCGUCGCGGGACAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AAAUCCGAGCUCUCUCA--| UG GC U G A GUUCUGU GCC CUGGGU AGUGGUUCU AACA UUCA CA \ CGG GGCCUA UCACCAGGA UUGU AAGU GU A AGACAGGGCGCUGCGCGUU^ CA GU U A - UAAUACG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pbv-Mir-203-v2_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0039004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUGGUUCUUAACAGUUCAACA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Pbv-Mir-203-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0039005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UGAAAUGUUUAGGACCACUUG -60
Get sequence
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| Variant | Pbv-Mir-203-v1 |
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| Seed | UGAAAUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAAUCCGAGCUCUCUCAGCCUGCUGGGUGCAGUGGUUCUUAACAGUUCAACAGUUCUGUAGCAUAAUUGUGAAAUGUUUAGGACCACUUGAUCCGGACGGCUUGCGCGUCGCGGGACAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AAAUCCGAGCUCUCUCA--| UG GC U G A UUCUGU GCC CUGGGU AGUGGUUCU AACA UUCA CAG \ CGG GGCCUA UCACCAGGA UUGU AAGU GUU A AGACAGGGCGCUGCGCGUU^ CA GU U A - AAUACG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pbv-Mir-203-v1_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0039004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUGGUUCUUAACAGUUCAACAG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Pbv-Mir-203-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0039005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- GUGAAAUGUUUAGGACCACUUG -60
Get sequence
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