| MirGeneDB ID | Pab-Mir-7180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7180 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-7180 Cfa-Mir-7180 Cja-Mir-7180 Dno-Mir-7180 Mml-Mir-7180 Ocu-Mir-7180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054679.2: 4052995-4053052 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAGGCUCUCUGAGGAUUGGUGGUUUCAGAGAGUGUACUUCCUGAGGCCUCUGGGUAUAAAAUUCCUGUGGCCUCUGGGUGUGUACCCUCUGUAGCUUCCAGAUUCAUACGUCCUGCAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GAGGCUCUCUGAGGAUU--| U U A U U UCUGGGUAU GG GGUU CAGAG GUGUAC UCC GAGGCC A CC UCGA GUCUC CAUGUG GGG CUCCGG A GACGUCCUGCAUACUUAGA^ U U C U U UGUCCUUAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Pab-Mir-7180_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUGUACUUCCUGAGGCCUCU -21
Get sequence
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| Mature sequence | Pab-Mir-7180_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UGGCCUCUGGGUGUGUACCCU -58
Get sequence
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