| MirGeneDB ID | Dno-Mir-7180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7180 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-7180 Cfa-Mir-7180 Cja-Mir-7180 Mml-Mir-7180 Ocu-Mir-7180 Pab-Mir-7180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH563092: 1728287-1728346 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUGGCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGGCUGUCCGAGGGUUGGGUGGUCUCGGGGAGGGUACUUCCUGGGGCCUCUGGGCAUGGACUUCCUGUGGCCUCUGGGUGUGUACCCUCUGUGGCUUCCAGUUUCCUACUUCUCGCAGCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGGCUGUCCGAGGGUUG----| U UC G UU- UG - UCU GCAU GG GGUC G GGAGGGUAC CC G GGCC GG G CC UCGG U UCUCCCAUG GG C CCGG CC G UCGACGCUCUUCAUCCUUUGA^ U -- G UGU GU U UGU UUCA . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-7180_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGGUACUUCCUGGGGCCUCUGG -23
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-7180_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- UGUGGCCUCUGGGUGUGUACCCUCU -60
Get sequence
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