| MirGeneDB ID | Pab-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1264 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1264 Cfa-Mir-1264 Cja-Mir-1264 Cpo-Mir-1264 Eca-Mir-1264 Ete-Mir-1264 Hsa-Mir-1264 Laf-Mir-1264 Mml-Mir-1264 Mmr-Mir-1264 Mmu-Mir-1264 Ocu-Mir-1264 Rno-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054702.2: 120501747-120501809 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1264) |
Mir-1912
CM054702.2: 120500650-120500703 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-1264 CM054702.2: 120501747-120501809 [+] UCSC Ensembl |
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| Seed | GGUCCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAUUGUGUUUCUCCAUGCCUGGCAUAUAGCAGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUUGAAAGAAUAAAUAAACCAACAAGUCUUAUUUGAGCACCUGUUAUGUGGAGGAUAAAAUCCUACGACCCAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 AAUUGUGUUUCUCCAUG---| GG C - U GAAAGAAU CCU CAUAUAGCAGGU CUCAA UAAG AUUUGUU \ GGA GUGUAUUGUCCA GAGUU AUUC UGAACAA A AGACCCAGCAUCCUAAAAUA^ G- C U - CCAAAUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Pab-Mir-1264_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUU -22
Get sequence
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| Co-mature sequence | Pab-Mir-1264_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAAGUCUUAUUUGAGCACCUGU -63
Get sequence
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