| MirGeneDB ID | Ete-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1264 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1264 Cfa-Mir-1264 Cja-Mir-1264 Cpo-Mir-1264 Eca-Mir-1264 Hsa-Mir-1264 Laf-Mir-1264 Mml-Mir-1264 Mmr-Mir-1264 Mmu-Mir-1264 Ocu-Mir-1264 Pab-Mir-1264 Rno-Mir-1264 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980336: 11901675-11901737 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-1264) |
Mir-1912
JH980336: 11900400-11900454 [+]
UCSC
Mir-1264 JH980336: 11901675-11901737 [+] UCSC |
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| Seed | AAGUCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUUGUUUUUCUUCAUGCCUGGCAUAUAGCAGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUUGAAAGAGUCAGUGAACCAACAAGUCUUAUUUUAACACCUGUUAUGUGGAGGAUAAAGAACUACGGCUCAGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CAUUGUUUUUCUUCAUG---| GG CCUC- U GAAAGAGU CCU CAUAUAGCAGGU AAUAAG AUUUGUU \ GGA GUGUAUUGUCCA UUAUUC UGAACAA C AGACUCGGCAUCAAGAAAUA^ G- CAAUU - CCAAGUGA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ete-Mir-1264_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGUCCUCAAUAAGUAUUUGUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ete-Mir-1264_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- CAAGUCUUAUUUUAACACCUGU -63
Get sequence
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