| MirGeneDB ID | Ofu-Novel-4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | OFU-NOVEL-4 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tubeworm (Owenia fusiformis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | O. fusiformis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | O. fusiformis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_903813345.2_Owenia) |
CAIIXF020000009.1: 37179703-37179762 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Novel-4) |
Novel-4
CAIIXF020000009.1: 37179703-37179762 [+]
Novel-5 CAIIXF020000009.1: 37180959-37181018 [+] |
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| Seed | CUUCAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AACUCUAUGACUAUUACUCUCCGUGUUUGUUGCCCUUCCUUUCCUUGAAGACAUUAUAGAUAACUUGUCUUCAGUAAAGUGAGGUGCUGCCAAACACAGACCAUAUCACCAAUAUUAAUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AACUCUAUGACUAUUACUC- C UU- -| UC C U UUAUA UC GUGUUUG GC CCU CUUU CU GAAGACA G AG CACAAAC CG GGA GAAA GA CUUCUGU A CUAAUUAUAACCACUAUACC A CGU U^ GU U - UCAAU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ofu-Novel-4_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGCCCUUCCUUUCCUUGAAGACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Ofu-Novel-4_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UCUUCAGUAAAGUGAGGUGCUGC -60
Get sequence
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