MirGeneDB ID | Ofu-Mir-1995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-1995 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tubeworm (Owenia fusiformis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cte-Mir-1995 Efe-Mir-1995-P1 Efe-Mir-1995-P2 Pdu-Mir-1995 Snu-Mir-1995 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Annelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Annelida | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_903813345.2_Owenia) |
CAIIXF020000001.1: 45643035-45643092 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UACAUUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAUAGUAACUAUAGCAACACCAUAGUAACUAUACAUUUCACAUUGUGACCGUGUCUUGCAAACGACGGUCUCAAGGUAAAAUGUAAUUUUGGUAUGGUUAACGUAGAUACGUUGCUAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CAUAGUAACUAUAGCAAC--| G CUA C A U GUCUU ACCAUA UAA UACAUUU AC UUG GACCGU G UGGUAU GUU AUGUAAA UG AAC CUGGCA C AAUCGUUGCAUAGAUGCAAU^ G UUA A G U GCAAA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Ofu-Mir-1995_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AUACAUUUCACAUUGUGACCGU -22
Get sequence
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Star sequence | Ofu-Mir-1995_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- GGUCUCAAGGUAAAAUGUAAUU -58
Get sequence
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