MirGeneDB ID | Neu-Mir-7379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7379 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7379 Sha-Mir-7379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 95935669-95935725 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7379) |
Mir-7378
CM051820.1: 95921105-95921163 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7379 CM051820.1: 95935669-95935725 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | CUGGAUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCUCAAAGAUAUGCCUUGAGGUAGUUUCUCUAUAUCACCCAUACAUCCAGAUCUAAUUGAAAAAUCUGGAUGCUUUGAUGGUGUAGAGACACUCCUUCAGACAGCAGCUCUGCUGAGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CCUCAAAGAUAUGCCUU--| U U CC UA- CUAAU GAGG AGU UCUCUAUAUCA CA CAUCCAGAU \ CUUC UCA AGAGAUGUGGU GU GUAGGUCUA U GAGUCGUCUCGACGACAGA^ C C A- UUC AAAAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Neu-Mir-7379_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAUAUCACCCAUACAUCCAGAUC -23
Get sequence
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Mature sequence | Neu-Mir-7379_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- UCUGGAUGCUUUGAUGGUGUAGA -57
Get sequence
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