| MirGeneDB ID | Mdo-Mir-7379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-7379 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray short-tailed opossum (Monodelphis domestica) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mdo-mir-7379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Neu-Mir-7379 Sha-Mir-7379 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (monDom5_add) |
X: 67706763-67706819 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7379) |
Mir-7378
X: 67691162-67691220 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7379 X: 67706763-67706819 [-] UCSC Ensembl |
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| Seed | CUGGAUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCUCAAAGAUACCCCUUGAGGCAGUUUCUCUAUAUCACCCAUACAUCCAGAUAUAAUUGAAAAAUCUGGAUGCUUUGAUGGUGUAGAGACACUCCUUCAGACAGCAUCUCUGCUGAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCUCAAAGAUACCCCUU--| C U CC UA- AUAAU GAGG AGU UCUCUAUAUCA CA CAUCCAGAU \ CUUC UCA AGAGAUGUGGU GU GUAGGUCUA U GAGUCGUCUCUACGACAGA^ C C A- UUC AAAAG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mdo-Mir-7379_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0028814 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAUAUCACCCAUACAUCCAGAUA -23
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7379-5p |
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| Mature sequence | Mdo-Mir-7379_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0028815 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UCUGGAUGCUUUGAUGGUGUAGA -57
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mdo-miR-7379-3p |
