MirGeneDB ID | Neu-Mir-7378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-7378 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Mdo-Mir-7378 Sha-Mir-7378 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Marsupialia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051820.1: 95921105-95921163 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-7378) |
Mir-7378
CM051820.1: 95921105-95921163 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-7379 CM051820.1: 95935669-95935725 [-] UCSC Ensembl |
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Seed | UGGGACA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AAGUGAUCAGGGUACUACUGAUUGACUGGAGUGGGACAUCUUCCAUGGAACUGGAUAUGCAUGAUAGCCCCUUAGGAGAUGUCCCAGUUCAGAAAAUCAGCCCUGCGACAUUUCCAAAAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AAGUGAUCAGGGUACUA--| GA G CAU AA GGAUAU CUGAUU CUGGA UGGGACAUCUUC GG CU \ GACUAA GACUU ACCCUGUAGAGG CC GA G AAAACCUUUACAGCGUCCC^ AA G AUU CC UAGUAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Neu-Mir-7378_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GUGGGACAUCUUCCAUGGAACU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Neu-Mir-7378_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- CCCCUUAGGAGAUGUCCCAGUU -59
Get sequence
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