MirGeneDB ID | Mom-Mir-2722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2722 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Mossy chiton (Mopalia muscosa) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Agr-Mir-2722 Eba-Mir-2722 Esc-Mir-2722 Hru-Mir-2722 Lgi-Mir-2722 Lhy-Mir-2722 Mgi-Mir-2722 Npo-Mir-2722 Obi-Mir-2722 Ovu-Mir-2722 Pve-Mir-2722 Rph-Mir-2722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Mollusca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Mollusca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_031763545.1_ASM3176354v1_genomic_Mom) |
JARFOD010000012.1: 703546-703606 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCGCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UUAAGUGGACCAUAAGUAUUUGAUUUCGGGUCAGGUGUUUCACGGGCGCUCCACUCAAACUAAAGCAGUGGCGCCGUGUAAACAUCUAACUCGAGGUAAGAACACUUCACCAGUAAUAACAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 UUAAGUGGACCAUAAGUA-- G C -| G UC CAAAC UUU AUUUCGGGU AGGUGUUU CACGG CGC CACU \ AGA UGGAGCUCA UCUACAAA GUGCC GCG GUGA U ACAAUAAUGACCACUUCACA A A U^ - -- CGAAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mom-Mir-2722_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAGGUGUUUCACGGGCGCUCCACU -25
Get sequence
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Mature sequence | Mom-Mir-2722_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UGGCGCCGUGUAAACAUCUAACU -61
Get sequence
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