| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-760 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-760 Cja-Mir-760 Cpo-Mir-760 Dno-Mir-760 Eca-Mir-760 Ete-Mir-760 Hsa-Mir-760 Laf-Mir-760 Mml-Mir-760 Mmr-Mir-760 Ocu-Mir-760 Pab-Mir-760 Rno-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr3: 122293614-122293671 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGCUCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGGAUGCCUCGGUGCGGGGCGCGUCGCCCCCCUCAGGCCACCAGAGCCCGGAUACCUCAGAAAUUCGGCUCUGGGUCUGUGGGGAGCGAAAUGCAACCCAAACCCCGUUUCCCCGAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGAUGCCUCGGUGC- G-| CG C U AC C UACCU GG GCG UCGC CCCC CAGGCC CAGAGCC GGA \ CC CGU AGCG GGGG GUCUGG GUCUCGG CUU C AGCCCCUUUGCCCCAAAC AA^ AA A U -- - AAAGA 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-760_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0017245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCCCUCAGGCCACCAGAGCCCGGA -24
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-760-5p miRDB: MIMAT0017245 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-760_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0003898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CGGCUCUGGGUCUGUGGGGAG -58
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003898 TargetScanVert: mmu-miR-760-3p miRDB: MIMAT0003898 |
