MirGeneDB ID | Cja-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-760 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-760 Cpo-Mir-760 Dno-Mir-760 Eca-Mir-760 Ete-Mir-760 Hsa-Mir-760 Laf-Mir-760 Mml-Mir-760 Mmr-Mir-760 Mmu-Mir-760 Ocu-Mir-760 Pab-Mir-760 Rno-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021921.1: 128993303-128993360 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCUCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGAGGAUGCCGCGGAGCGGGGCGCGUCGCCCCCCUCAGUCCACCAGAGCCCGGAUACCUCAGAAAUUCGGCUCUGGGUCUGUGGGGAGCGAAAUGCAACCCAAACCCCGUUUUUCUGAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGAUGCCGCGGAGC- G-| CG C U UCCA CGGAUACC GG GCG UCGC CCCC CAG CCAGAGCC U CC CGU AGCG GGGG GUC GGUCUCGG C AGUCUUUUUGCCCCAAAC AA^ AA A U UG-- CUUAAAGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cja-Mir-760_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCCCUCAGUCCACCAGAGCCCGG -23
Get sequence
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Mature sequence | Cja-Mir-760_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- CGGCUCUGGGUCUGUGGGGAG -58
Get sequence
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