MirGeneDB ID | Ete-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-760 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-760 Cja-Mir-760 Cpo-Mir-760 Dno-Mir-760 Eca-Mir-760 Hsa-Mir-760 Laf-Mir-760 Mml-Mir-760 Mmr-Mir-760 Mmu-Mir-760 Ocu-Mir-760 Pab-Mir-760 Rno-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (echTel2) |
scaffold_287966: 11089-11146 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCUCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CAGGGACGCUGCGGCACGGGGCGCGUCGCCCCGCUCAGUCCGCCAGAGCGCGGAUGUCUCCGAAAUUCGGCUCUGGGUCUGUGGGGUGCGAAAUGCAACCCCCCUCCCGAGCCCCGCGGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 CAGGGACGCUGCGGCAC- G- CG -| GCU U GC G UGUCU GG GCG UCGC CCC CAG CC CAGAGC CGGA \ CC CGU AGCG GGG GUC GG GUCUCG GCUU C GCGCCCCGAGCCCUCCCC AA AA U^ GU- U -- - AAAGC 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Ete-Mir-760_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCGCUCAGUCCGCCAGAGCGCGGA -24
Get sequence
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Mature sequence | Ete-Mir-760_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- CGGCUCUGGGUCUGUGGGGUG -58
Get sequence
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