MirGeneDB ID | Cpo-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-760 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cpo-mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-760 Cja-Mir-760 Dno-Mir-760 Eca-Mir-760 Ete-Mir-760 Hsa-Mir-760 Laf-Mir-760 Mml-Mir-760 Mmr-Mir-760 Mmu-Mir-760 Ocu-Mir-760 Pab-Mir-760 Rno-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (cavPor3) |
scaffold_2: 19580894-19580951 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCUCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGGUGAGGCCGCGGCGCAGGGUACGGCGCCCCCCUCAGUCUGCCAGAGCCCGGAUGCCUCAGAAAUUCGGCUCUGGGUCUGUGGGGGACGAAAUGCAACCCAGUCUCCAUUUUCCUGAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GGGUGAGGCCGCGGCGCAGG--| CGG C U U UG C UGCCU GUA CG CCCCC CAG C CCAGAGCC GGA \ CGU GC GGGGG GUC G GGUCUCGG CUU C AGUCCUUUUACCUCUGACCCAA^ AAA A U U -- - AAAGA 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cpo-Mir-760_5p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCCCUCAGUCUGCCAGAGCCCGGA -24
Get sequence
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Mature sequence | Cpo-Mir-760_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047384 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- CGGCUCUGGGUCUGUGGGGGA -58
Get sequence
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