| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-2387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2387 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-2387 Cfa-Mir-2387 Cpo-Mir-2387 Ocu-Mir-2387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007677.1: 33760174-33760228 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAAGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAGGCCGGCCAGGCCGGAGCGUGGAGGGCCUGGAAGGCCUGGCUUUGCAGCGUGGACUGGACCCUGCAGACCCGGCCUUGGCAAGCUCUUCCGCUGACUCCCCGCGGCCGAGGAAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GAGGCCGGCCAGGCCGG---| U C G- U C C GGA AGCG GGAGGGC UG AAGGCC GG UUUGCAG GU \ UCGC CUUCUCG AC UUCCGG CC AGACGUC CA C AAGGAGCCGGCGCCCCUCAG^ - A GG C - C GGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-2387_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGAAGGCCUGGCUUUGCAGCGU -23
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-2387_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
32- CCUGCAGACCCGGCCUUGGCAAG -55
Get sequence
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