MirGeneDB ID | Cpo-Mir-2387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2387 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Guinea pig (Cavia porcellus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cpo-mir-2387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-2387 Cfa-Mir-2387 Mmr-Mir-2387 Ocu-Mir-2387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (cavPor3) |
scaffold_234: 708165-708219 [-] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGAAGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GAAAGGCGGCCAGGCCAUGGCGUGAGGGCCUGGAAGGCCCAGCUUUGCAGUGUGGACUGCACCCUGCAGACCUGGCCUUAGCAAACUCUCACACUGAUGACCCCGUGGCAGGAGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GAAAGGCGGCCAGGCCAU-- C CC G- C C --| UGG GG GUGAGGG UG AAGG CCAG UUUGCA GUG \ UC CACUCUC AC UUCC GGUC AGACGU CAC A CGAGGACGGUGCCCCAGUAG A AA GA - C CC^ GUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cpo-Mir-2387_5p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGGAAGGCCCAGCUUUGCAGUG -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Cpo-Mir-2387_3p (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0047432 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
32- CCUGCAGACCUGGCCUUAGCAAA -55
Get sequence
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