| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-2387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2387 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-2387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-2387 Cpo-Mir-2387 Mmr-Mir-2387 Ocu-Mir-2387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr6: 5910334-5910388 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGAAGGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AGAGGCCGGCCAGGCGGAGCGUGGAGGGCCUGGAAGGCCUGGCUUUGCAGCGUGUUCUGGACUCUGCAGACCCGGCCUUGGCAAGCUCUUCCGCUGACGUCCCCGCGGCCGGAGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 AGAGGCCGGCCAGGCGG---| U C G- U C C GUU AGCG GGAGGGC UG AAGGCC GG UUUGCAG GU \ UCGC CUUCUCG AC UUCCGG CC AGACGUC CA C CGAGGCCGGCGCCCCUGCAG^ - A GG C - U GGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-2387_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGGAAGGCCUGGCUUUGCAGCGU -23
Get sequence
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| Star sequence | Cfa-Mir-2387_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0034370 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
32- UCUGCAGACCCGGCCUUGGCAAG -55
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-2387 miRDB: MIMAT0034370 |
