| MirGeneDB ID | Mmr-Mir-1296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1296 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1296 Cfa-Mir-1296 Cja-Mir-1296 Cpo-Mir-1296 Dno-Mir-1296 Eca-Mir-1296 Ete-Mir-1296 Hsa-Mir-1296 Laf-Mir-1296 Mml-Mir-1296 Ocu-Mir-1296 Pab-Mir-1296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007675.1: 32125217-32125281 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGAAAUCAACGAAUCACCUACCUAACUGGGUUAGGGCCCUGGCUCCAUCUCCUUUAGGAAAACCUUCUGUGGGGAGUGGGGCUUUGACCCUAACCCAGGUGGGCUGUAACACUGCUGCAUUUUCUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAAAUCAACGAAUCACCUA--| A CCCU U UUAGGAAA CCUA CUGGGUUAGGG GGCUCCA CUCCU A GGGU GACCCAAUCCC UCGGGGU GAGGG C UCUUUUACGUCGUCACAAUGUC^ G AGUU - GUGUCUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmr-Mir-1296_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUAGGGCCCUGGCUCCAUCUCCU -23
Get sequence
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| Star sequence | Mmr-Mir-1296_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- AGUGGGGCUUUGACCCUAACC -65
Get sequence
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