| MirGeneDB ID | Dno-Mir-1296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1296 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAGGGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-1296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1296 Cfa-Mir-1296 Cpo-Mir-1296 Ete-Mir-1296 Hsa-Mir-1296 Mml-Mir-1296 Ocu-Mir-1296 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH570374: 358225-358289 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGAAAUCAACGAAUCACCUACCUAACUGGGUUAGGGCCCUGGCUCCAUCUCCUUUAGGAAAAUCUUCUGUGGGGAGUGGGGUUUCGACCCUAACCCAGCUGGGCUGUAACACUGCUGCAUGUUCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAAAUCAACGAAUCACCUA--| A CCCU U UUUAGGAAA CCUA CUGGGUUAGGG GGCUCCA CUCC A GGGU GACCCAAUCCC UUGGGGU GAGG U UCUUGUACGUCGUCACAAUGUC^ C AGCU - GGUGUCUUC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-1296_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0048039 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUAGGGCCCUGGCUCCAUCUCC -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-1296_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0048040 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
44- AGUGGGGUUUCGACCCUAACC -65
Get sequence
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