| MirGeneDB ID | Hme-Mir-2763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2763 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | hme-mir-2763 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | H. melpomene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | H. melpomene | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Hmel_1) |
HE672065: 139460-139521 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-2763-v1) |
Mir-2763-v1
HE672065: 139460-139521 [-]
Ensembl
Mir-2763-v2 HE672065: 139460-139521 [-] Ensembl |
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| Variant | Hme-Mir-2763-v1 |
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| Seed | AUUAUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UACGUAUAAUUAAUUAAUCUACAACGUCACCCAAAGUAGUGAACGUAAUUUAUCGUGAGCUAUCUAUAGAUAUUAUGCUCAUUACUUUGGAGAAGUUGUACGAACAUUCAUCGAUGGAGAAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UACGUAUAAUUAAUUAA-- -| G AC A UU GUGAGC UC UACAAC UC CCAAAGUAGUGA CGUAA UAUC U AG AUGUUG AG GGUUUCAUUACU GUAUU AUAG A UAAGAGGUAGCUACUUACA C^ A A- C -- AUAUCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hme-Mir-2763-v1_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAAAGUAGUGAACGUAAUUUAUC -24
Get sequence
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| Mature sequence | Hme-Mir-2763-v1_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0024955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UAUUAUGCUCAUUACUUUGGAG -62
Get sequence
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| Variant | Hme-Mir-2763-v2 |
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| Seed | UAUUAUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UACGUAUAAUUAAUUAAUCUACAACGUCACCCAAAGUAGUGAACGUAAUUUAUCGUGAGCUAUCUAUAGAUAUUAUGCUCAUUACUUUGGAGAAGUUGUACGAACAUUCAUCGAUGGAGAAUGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 UACGUAUAAUUAAUUAA-- -| G AC A UU GUGAGC UC UACAAC UC CCAAAGUAGUGA CGUAA UAUC U AG AUGUUG AG GGUUUCAUUACU GUAUU AUAG A UAAGAGGUAGCUACUUACA C^ A A- C -- AUAUCU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Hme-Mir-2763-v2_5p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CCAAAGUAGUGAACGUAAUUUAUCG -25
Get sequence
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| Mature sequence | Hme-Mir-2763-v2_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0024955 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- AUAUUAUGCUCAUUACUUUGGAG -62
Get sequence
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