| MirGeneDB ID | Ete-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-769 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-769 Cfa-Mir-769 Cja-Mir-769 Cpo-Mir-769 Dno-Mir-769 Eca-Mir-769-P4 Eca-Mir-769-P5 Hsa-Mir-769 Laf-Mir-769-P1 Laf-Mir-769-P2 Laf-Mir-769-P3 Mml-Mir-769 Mmr-Mir-769 Pab-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980338: 11049700-11049760 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CGACGUGGUGCCUAUUCCUGGGCUCUGACUCAAGACCUCUGGGUUCUGAGCCCUGAUGUGGCUGCCGAGCUGGGAUCUCCGGGGUUUUGGUUCAGGGUCAGGGCCUCUGGGUUCUGAGUACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CGACGUGGUGCCUAUUC--| G CU U U G CCUGAUGU CU GGCUCUGA CAAGACCUC GGG UCU AGC \ GG CUGGGACU GUUUUGGGG CUC AGG UCG G CAUGAGUCUUGGGUCUCCG^ A UG C U G AGCCGUCG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ete-Mir-769_5p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CAAGACCUCUGGGUUCUGAGCC -22
Get sequence
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| Star sequence | Ete-Mir-769_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CUGGGAUCUCCGGGGUUUUGGU -61
Get sequence
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