| MirGeneDB ID | Laf-Mir-769-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-769 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Laf-Mir-769-P1 Laf-Mir-769-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-769 Cfa-Mir-769 Cja-Mir-769 Cpo-Mir-769 Dno-Mir-769 Ete-Mir-769 Hsa-Mir-769 Mml-Mir-769 Mmr-Mir-769 Pab-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | L. africana | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010031.1: 5232861-5232921 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGACUCGGUGCCGAUUCCUGGGCUCUGACCUGAGACCUCUGGGUUCUGAGCUGUGAUGUCGCUUCUGAGCUGGGACCUCCGGGGUCUUGGUUCAGGGUCGGGGCCUCUAGGUUCCGAGCACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGACUCGGUGCCGAUUC--| G C UG U U G GUGAUGU CU GGCUCUGA C AGACCUC GGG UCU AGCU \ GG CUGGGACU G UCUGGGG CUC AGG UCGA C CACGAGCCUUGGAUCUCCG^ G U GU C C G GUCUUCG . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Laf-Mir-769-P2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGACCUCUGGGUUCUGAGCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Laf-Mir-769-P2_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CUGGGACCUCCGGGGUCUUGGU -61
Get sequence
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