| MirGeneDB ID | Ete-Mir-328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-328 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Lesser hedgehog tenrec (Echinops telfairi) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-328 Cfa-Mir-328 Cja-Mir-328 Cpo-Mir-328 Dno-Mir-328 Eca-Mir-328 Hsa-Mir-328 Laf-Mir-328 Mml-Mir-328 Mmr-Mir-328 Mmu-Mir-328 Ocu-Mir-328 Pab-Mir-328 Rno-Mir-328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (echTel2) |
JH980312: 18343632-18343689 [+] UCSC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UGGCCCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGGCCGUCUCGGAGCCUGAGGCGGAGGGCGGGGAGGCAGUAGGGGCUCAGGGGGAGUGUGUGCAGCCCUGGCCCUCUCUGCCCUUCCGCCCCCCGGCCCCGCCCCGCGCUACCGCUACGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 GGGCCGUCUCGGAGCCU- A -| A GA UA U GGAGUG G GG CGG GGGCGGG GGCAG GGGGC CAGGG \ C CC GCC CCCGCCU CCGUC UCCCG GUCCC U CAUCGCCAUCGCGCCCCG C G^ C UC UC - GACGUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ete-Mir-328_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GGGAGGCAGUAGGGGCUCAGGG -22
Get sequence
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| Mature sequence | Ete-Mir-328_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- CUGGCCCUCUCUGCCCUUCCG -58
Get sequence
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