MirGeneDB ID | Emu-Mir-2014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2014 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Muellers freshwater sponge (Ephydatia muelleri) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aqu-Mir-2014-P1 Aqu-Mir-2014-P2 Aqu-Mir-2014-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Demospongiae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Demospongiae | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_013339895_Emu) |
JABACO010000010.1: 1205281-1205363 [+] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGAUUGG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GGACAGAGGCGACGAGCAUGCAUUGCAUUGUAGAUUGGGCUUGGUCGGCAGGAAAAAAGCGAUGCUCCUCCUUCGAGGCGAUACCGCAUCCUGCCAAACAAGUCCGAUCUACAAGGUGUGCUUGCUCGCACCGCAAGGCGUGAGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 60 70 GGACAGAGGCGACGAGCAU UU ----| GUC AAAAAAGCGAUGCUCCUC GCA GCAU UGUAGAUUGGGCUUG GGCAGG \ CGU CGUG ACAUCUAGCCUGAAC CCGUCC C AGUGCGGAACGCCACGCU- U- UGGA^ AAA UACGCCAUAGCGGAGCUU 140 130 120 110 100 90 80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Emu-Mir-2014_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAGAUUGGGCUUGGUCGGCAGG -22
Get sequence
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Star sequence | Emu-Mir-2014_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
62- GCCAAACAAGUCCGAUCUACA -83
Get sequence
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