| MirGeneDB ID | Ebu-Mir-26-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-26 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Inshore hagfish (Eptatretus burgeri) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ebu-Mir-26-P5 Ebu-Mir-26-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | E. burgeri | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Eburgeri_3) |
FYBX02010372.1: 1513076-1513135 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAAGUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUUAUCUCAAACGCGGGGUUGGAAUCCCGGUUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCUGUGUGUGUUCAACGGGCCUGUCCUCGAUUGCUUGCUUUGGGUGCAACCUCCUGGGCACCACCAUCAGGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUUAUCUCAAACGCGGG----| GAAU UU C GUGUGU GUUG CCCGG CAAGUAAUC AGGAUAGGCU G CAAC GGGUU GUUCGUUAG UCCUGUCCGG U GGACUACCACCACGGGUCCUC^ GU-- UC C GCAACU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Ebu-Mir-26-P6_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Ebu-Mir-26-P6_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
38- CCUGUCCUCGAUUGCUUGCUUU -60
Get sequence
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