| MirGeneDB ID | Ebu-Mir-203-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-203 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Inshore hagfish (Eptatretus burgeri) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Ebu-Mir-203-P4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Lch-Mir-203 Pma-Mir-203-o3-v1 Spt-Mir-203 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | E. burgeri | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Eburgeri_3) |
FYBX02006070.1: 702849-702910 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAAAUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UGGGAAUGUUCGUGUCAGGUUUUUCCAUCCAGUGGUUCUAAUCAGUUCACAAUGUUCUGAUAUGACGAUGUGAAAUGUUUAGGACCACUAUGAUGGUUGAACUACGUACACCAAUCGGAGCAGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UGGGAAUGUUCGUGUCA-- UU C-| U G AUGUUCUG GGUUU CCAUC AGUGGUUCUAA CA UUCACA \ UCAAG GGUAG UCACCAGGAUU GU AAGUGU A ACGAGGCUAACCACAUGCA UU UA^ U A AGCAGUAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Ebu-Mir-203-P3_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUGGUUCUAAUCAGUUCACA -21
Get sequence
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| Mature sequence | Ebu-Mir-203-P3_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UGAAAUGUUUAGGACCACUAUG -62
Get sequence
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