MirGeneDB ID | Dya-Mir-966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-966 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila yakuba) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dme-Mir-966 Dsi-Mir-966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_yakuba.dyak_caf1.dna.toplevel) |
2L: 13146739-13146794 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUGGGAU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
AUUCCGCUCGGCUGUAACCUGAUCCGCUGCUGUGGGAUGUGGGAUGUGGGCUGUGGUAUAGGUGCCGCCAGUUGAUAACCCCCAGCGUGGGCACGGCCCCACUGGUCGUCAACCGCGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 AUUCCGCUCGGCUGUAA--- -| A U U A G A UG UGUGG CC UG UCCGC GCUG GGG UGU GG UG GGC U GG AC GGGUG CGAC CCC AUA UU AC CCG A CGCCAACUGCUGGUCACCCC C^ - - C A G G CG UGGAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dya-Mir-966_5p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGUGGGAUGUGGGAUGUGGGCU -22
Get sequence
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Star sequence | Dya-Mir-966_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- CCGCCAGUUGAUAACCCCCAGC -56
Get sequence
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