| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-966 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dme-Mir-966 Dya-Mir-966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | D. melanogaster subgroup | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2L: 5841006-5841062 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUGGGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
UCGGCUGUAACCUGAUCCGCUGCUGUGGGCUGUGGGCUGUGGGCUGUAAGGCUGUGGUAUAGGUGCCGCCAGUUGAUAACCCCCAGCGUGGGCACGGCCCCACUGGUCGUCAACCGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 UCGGCUGUAACCUGAUCC- C --|G U C G UAA UGUGG GCUG UGU G GCUG GGG UGU GGCUG GGC U CGGC ACG U CGAC CCC AUA UUGAC CCG A CGCCAACUGCUGGUCACCC - GG^G C A G CG- UGGAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dsi-Mir-966_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGUGGGCUGUGGGCUGUAAGGCU -23
Get sequence
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| Star sequence | Dsi-Mir-966_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
35- CCGCCAGUUGAUAACCCCCAGC -57
Get sequence
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