| MirGeneDB ID | Dno-Mir-342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-342 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dno-mir-342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-342 Cfa-Mir-342 Cja-Mir-342 Cpo-Mir-342 Eca-Mir-342 Ete-Mir-342 Hsa-Mir-342 Laf-Mir-342 Mml-Mir-342 Mmr-Mir-342 Mmu-Mir-342 Ocu-Mir-342 Pab-Mir-342 Rno-Mir-342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH561489: 96895-96961 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CUCACAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCUCAAGCCCAGAAACGGGGCUCAAGGUGAGGGGUGCUAUCUGUGAUUGAGGGACAUGGUAAAUGGAAUUGUCUCACACAGAAAUCGCACCCGUCACCUUGGCCUGCGUAGCACCACCCCCUCAGCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 60 CUCUCAAGCCCAGAAACG--- U G UA--| AUUGA UGGUAA GGGC CAAGGUGA GGGUGC UCUGUG GGGACA \ UCCG GUUCCACU CCCACG AGACAC CUCUGU A CGACUCCCCCACCACGAUGCG - G CUAA^ A---- UAAGGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dno-Mir-342_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0047825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGGGGUGCUAUCUGUGAUUGAGGGACA -27
Get sequence
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| Mature sequence | Dno-Mir-342_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0047826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
42- UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUCA -67
Get sequence
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