MirGeneDB ID | Dno-Mir-2483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-2483 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-2483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-2483 Cfa-Mir-2483 Eca-Mir-2483 Ete-Mir-2483 Laf-Mir-2483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH561779: 237389-237444 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUCAAUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
GUGACACCCAGAUAUGUGAGUGAAAAUUUCCAUCAAUCAUUCAGCUGUUUGGGGUGAUGCAAACAAACAUCUGGUUGGUUGAGAGAAUUUUUCACUUAGUGUCAGGUUUAAAAACUGet precursor sequence |
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Structure | 10 20 30 40 50 GUGACACCCAGAUAUGU--| U CA UU C GGGUG GAGUGAAAA UUC UCAAUCA CAG UGUUUG A UUCACUUUU AAG AGUUGGU GUC ACAAAC U UCAAAAAUUUGGACUGUGA^ U AG UG U AAACG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dno-Mir-2483_5p |
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mirBase accession | MIMAT0048057 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAUCAAUCAUUCAGCUGUUUGG -22
Get sequence
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Star sequence | Dno-Mir-2483_3p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0048058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- AAACAUCUGGUUGGUUGAGAGA -56
Get sequence
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