| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-2483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2483 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-2483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-2483 Dno-Mir-2483 Eca-Mir-2483 Ete-Mir-2483 Laf-Mir-2483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chrX: 96560910-96560965 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GUCAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CUCUCUCUCAGAUAUUUGAGUGAAAAGUUCAGUCAACCAUCCAGCUGUUUGAGUUGAUGCAAGCAAACAUCUGGUUGGUUGAGAGAAUUUUUUACUUAGUCUCUGGAUGUUUGGAGGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CUCUCUCUCAGAUAUUU--| AG U C AGUUG GAGUGAAAAGUUC UCAACCA CCAG UGUUUG A UUCAUUUUUUAAG AGUUGGU GGUC ACAAAC U GAGGUUUGUAGGUCUCUGA^ AG U U GAACG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-2483_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0034421 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGUCAACCAUCCAGCUGUUUGA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-2483 miRDB: MIMAT0034421 |
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| Star sequence | Cfa-Mir-2483_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- AAACAUCUGGUUGGUUGAGAGA -56
Get sequence
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